40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1070    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  46.09 
 
 		 486 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  36.86 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  35.66 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  37.05 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  37.05 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  37.05 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  35.01 
 
 		 527 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  40.79 
 
 		 519 aa  273  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  36.08 
 
 		 505 aa  259  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  33.07 
 
 		 516 aa  194  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  29.51 
 
 		 543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  30.16 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  29.91 
 
 		 594 aa  160  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  27.68 
 
 		 579 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  27.68 
 
 		 579 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  31.97 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  29.36 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  28.44 
 
 		 579 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  29.32 
 
 		 607 aa  153  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  31.32 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  29.58 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  31.5 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  31.38 
 
 		 518 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  39 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  31.55 
 
 		 557 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  32.98 
 
 		 522 aa  130  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  29.64 
 
 		 539 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  28.96 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  42.06 
 
 		 575 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  33.05 
 
 		 472 aa  107  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  30.98 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  29.73 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  42 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  34.44 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  41.43 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  32.03 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  31.13 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>