More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3118 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
235 aa  484  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  50.65 
 
 
241 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 
245 aa  222  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
254 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 
255 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0202  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
257 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1895  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3870  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2963  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
787 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0080512  hitchhiker  0.000919293 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
323 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  31.92 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  37.02 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
331 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
255 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
273 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
324 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
320 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
325 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
331 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
230 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
331 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
319 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
231 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
234 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
256 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
227 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
256 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
320 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
262 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1143  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
245 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.290738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
272 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
329 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.98 
 
 
252 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  28.7 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
314 aa  98.2  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  30.54 
 
 
313 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
337 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
324 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
318 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
314 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.19 
 
 
317 aa  96.3  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
323 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
606 aa  95.1  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
337 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
613 aa  94.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.95 
 
 
237 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
514 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
238 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
315 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
318 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
343 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
324 aa  92.4  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.82 
 
 
316 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  29.36 
 
 
328 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.71 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  31.22 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1130  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
336 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.22 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.22 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  31.22 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.22 
 
 
322 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
320 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  30.58 
 
 
324 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  32.39 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
342 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2546  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0757946  normal  0.0982432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
314 aa  89  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
343 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
243 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  30.17 
 
 
574 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
336 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
368 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
336 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
276 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
339 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  32.39 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  28.02 
 
 
317 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
335 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3970  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.827134  normal  0.0578688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>