126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0957 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0957  glycosyltransferase ycbB  100 
 
 
137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00339368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  52.67 
 
 
232 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  45.8 
 
 
229 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  52.67 
 
 
227 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  50 
 
 
234 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  48.82 
 
 
242 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  48.82 
 
 
242 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  48.03 
 
 
242 aa  129  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  46.46 
 
 
242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5557  hypothetical protein  46.92 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.04 
 
 
243 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
252 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  40.91 
 
 
238 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  39.69 
 
 
243 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  42.42 
 
 
245 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
237 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
245 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
237 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
245 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
245 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2054  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
237 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2681  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
249 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0123554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
243 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
250 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  28.57 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
314 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
299 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
340 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
226 aa  67  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
295 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
285 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
250 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
336 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
340 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
340 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.25 
 
 
749 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
353 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
347 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  27.42 
 
 
574 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
255 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
305 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
236 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
276 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
311 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.6 
 
 
233 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
313 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
262 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
321 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  28.44 
 
 
260 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
344 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
311 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
307 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.91 
 
 
272 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
450 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  32.06 
 
 
291 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.93 
 
 
264 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
355 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.36 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
243 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
293 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
301 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  27.45 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.91 
 
 
249 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
246 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  29.41 
 
 
388 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  29.41 
 
 
388 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
304 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 
448 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.33 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
298 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.92 
 
 
241 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
237 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.25 
 
 
299 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  27.87 
 
 
318 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
230 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.77 
 
 
410 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.43 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.09 
 
 
305 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
298 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
420 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
312 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
336 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.47 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
230 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
238 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
246 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>