More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1090 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
236 aa  480  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  57.92 
 
 
230 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  58.49 
 
 
226 aa  243  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
228 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  55 
 
 
231 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  43.85 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  46.22 
 
 
231 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  45.05 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  45.98 
 
 
246 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  40.36 
 
 
279 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  41.28 
 
 
285 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3054  cell wall biogenesis glycosyltransferase  45.65 
 
 
267 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 
273 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0116  glycosyl transferase family 2  43.89 
 
 
265 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5268  glycosyl transferase family 2  44.8 
 
 
282 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0375  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
337 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 
238 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  40.67 
 
 
221 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0170  glycosyl transferase family 2  43.61 
 
 
250 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121302  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3245  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
277 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.164369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06720  glycosyl transferase  36.08 
 
 
445 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  36.53 
 
 
206 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
213 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  36.49 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0243  glycosyl transferase family 2  42.25 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1312  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
209 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1450  glycosyl transferase family protein  39.19 
 
 
232 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
314 aa  96.3  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
226 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  34.72 
 
 
693 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
305 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
344 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
280 aa  89  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
355 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
324 aa  85.9  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
253 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.6 
 
 
410 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0423  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.1 
 
 
518 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0489  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.1 
 
 
514 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
311 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0480  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.49 
 
 
518 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0508  group 2 family glycosyl transferase  30.49 
 
 
514 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
311 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0419  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.1 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4812  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.27 
 
 
514 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  34.5 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.65 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  28.38 
 
 
410 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
414 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.54 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.38 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0562  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.66 
 
 
524 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0425  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
514 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  41 
 
 
1099 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
321 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.96 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0511  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.66 
 
 
518 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
510 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
362 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  33.16 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
411 aa  75.5  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  27.96 
 
 
334 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  36 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0564  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.05 
 
 
514 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>