More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3000 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
330 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  63.58 
 
 
332 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  61.51 
 
 
313 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  60.57 
 
 
346 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  64.78 
 
 
317 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  61.64 
 
 
327 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  60.26 
 
 
332 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  62.3 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  58.82 
 
 
322 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  57.19 
 
 
346 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  60.4 
 
 
325 aa  341  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  57.47 
 
 
330 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  62.42 
 
 
310 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  61.72 
 
 
321 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  58.8 
 
 
314 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  58.8 
 
 
314 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  52.17 
 
 
334 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
335 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
335 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  48.82 
 
 
307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  48.14 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  49.32 
 
 
314 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  49.32 
 
 
324 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  48.38 
 
 
314 aa  252  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  43.05 
 
 
312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  41.69 
 
 
317 aa  225  7e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
308 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
307 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
308 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
303 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
315 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  31.86 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.77 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
305 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
310 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
344 aa  123  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
336 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
319 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
285 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
329 aa  105  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
394 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
355 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.2 
 
 
382 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
295 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
272 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
221 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
448 aa  96.7  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.88 
 
 
410 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  33.62 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  35.09 
 
 
276 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.91 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
313 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
374 aa  93.2  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
336 aa  92.4  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
305 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
378 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
229 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
559 aa  85.9  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  28.74 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  26.39 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  31.72 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>