More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 
312 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  65.66 
 
 
319 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  59.28 
 
 
359 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.97 
 
 
319 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.85 
 
 
334 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.85 
 
 
334 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.85 
 
 
334 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  61.49 
 
 
324 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  58.86 
 
 
316 aa  331  9e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  64.51 
 
 
302 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.85 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.55 
 
 
326 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.31 
 
 
342 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.87 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.44 
 
 
343 aa  248  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.65 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.43 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  53.27 
 
 
320 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  51.46 
 
 
324 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.57 
 
 
325 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  52.02 
 
 
329 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  49.84 
 
 
330 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  50.98 
 
 
318 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.79 
 
 
325 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.01 
 
 
335 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
510 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  32.03 
 
 
402 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  33.69 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  33.69 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  27.4 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  28.57 
 
 
408 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  28.57 
 
 
408 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  27.76 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  37.1 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
522 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  32.59 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  36.28 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.69 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.83 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  34.68 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  32 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  39.09 
 
 
693 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  41.14 
 
 
228 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
213 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  29.56 
 
 
448 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2811  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.23 
 
 
512 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0330825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2760  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.23 
 
 
796 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0289514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3020  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.23 
 
 
793 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
241 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 
226 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  32.8 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3022  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
773 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  27.11 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2535  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.31 
 
 
409 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0423  cell wall biogenesis glycosyltransferase  33.9 
 
 
518 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  28.9 
 
 
406 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 
234 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.6 
 
 
410 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
503 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  28.57 
 
 
408 aa  59.7  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
394 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2743  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
796 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  32.86 
 
 
231 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  31.41 
 
 
226 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  28.73 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.67 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
231 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  41.46 
 
 
1099 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  40.8 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
221 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0425  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
514 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0511  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 
518 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0562  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.2 
 
 
524 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
236 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0564  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.2 
 
 
514 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  28.32 
 
 
406 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
231 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1867  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
507 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0742867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4812  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.93 
 
 
514 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>