161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2312 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 
335 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  51.31 
 
 
329 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.14 
 
 
343 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.11 
 
 
326 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.21 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.74 
 
 
342 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.55 
 
 
321 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  40.06 
 
 
335 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.39 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.97 
 
 
325 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  38.01 
 
 
359 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.73 
 
 
299 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
320 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.27 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  42.09 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 
324 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
316 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.01 
 
 
312 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.35 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.26 
 
 
319 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.65 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.57 
 
 
324 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.54 
 
 
334 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.54 
 
 
334 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.54 
 
 
334 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  38.87 
 
 
302 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
510 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  30.81 
 
 
395 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  30.81 
 
 
395 aa  75.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  29.03 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  29.73 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  29.73 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  29.19 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  28.74 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  29.19 
 
 
408 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  27.89 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  30.65 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  30.65 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.14 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  31.52 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  30.15 
 
 
365 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.89 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  35.4 
 
 
693 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  27.67 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  25.94 
 
 
408 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  36.89 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  24.23 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  25.21 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  28.88 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
413 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  26.05 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05405  putative glycosyltransferase  29.32 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.507881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.26 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
242 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
228 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  28.4 
 
 
285 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
403 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
394 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
231 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
365 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
272 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
209 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
241 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  33.01 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
245 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
258 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.42 
 
 
382 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.32 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.63 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0083  glycosyltransferase  37.5 
 
 
228 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.413849  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
231 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0208  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.21 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.27 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0145  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.21 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  29.21 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
260 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
374 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
311 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  28.33 
 
 
448 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
393 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  24.74 
 
 
416 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
241 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>