More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3310 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
359 aa  724    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  73.77 
 
 
334 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  70.45 
 
 
319 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  73.77 
 
 
334 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  73.77 
 
 
334 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  70.55 
 
 
319 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  67.8 
 
 
302 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  65.55 
 
 
324 aa  378  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  61.26 
 
 
316 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  59.28 
 
 
312 aa  344  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.32 
 
 
315 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.31 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.73 
 
 
342 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.73 
 
 
321 aa  239  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.08 
 
 
334 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  49.82 
 
 
324 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  46.06 
 
 
335 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.31 
 
 
326 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.35 
 
 
299 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  47.25 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  45.66 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.67 
 
 
325 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
329 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.1 
 
 
325 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.01 
 
 
335 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  45.34 
 
 
318 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
510 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  33.68 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  27.56 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  27.94 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  27.24 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  33.88 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  31.91 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  31.91 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
236 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  25.62 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
228 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  31.87 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  44.04 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  30.77 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
222 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  30 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  31.64 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  29.57 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
522 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
230 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  28.89 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.91 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
222 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  27.7 
 
 
409 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  26.73 
 
 
448 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
299 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
213 aa  63.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.98 
 
 
409 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
273 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  32.61 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  26.76 
 
 
408 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
222 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  27.81 
 
 
408 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
304 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  25.12 
 
 
408 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  30.47 
 
 
356 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1867  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
507 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0742867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.18 
 
 
409 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  28.69 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3020  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
793 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  29.49 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2811  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
512 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0330825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2760  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 
796 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0289514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  26.51 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  27.23 
 
 
416 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3022  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.27 
 
 
773 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
346 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  36.73 
 
 
512 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  27.96 
 
 
410 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
310 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.9 
 
 
407 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
258 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
234 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
503 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.63 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  26.09 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  34.31 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.7 
 
 
693 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  24.6 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>