61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2601 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  79.31 
 
 		 408 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  74.57 
 
 		 407 aa  660    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  851    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  78.82 
 
 		 406 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  76.56 
 
 		 409 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  72.1 
 
 		 407 aa  627  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  72.1 
 
 		 407 aa  627  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  72.1 
 
 		 407 aa  627  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  70.12 
 
 		 406 aa  625  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  67.98 
 
 		 409 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  65.59 
 
 		 406 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  61.88 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  61.6 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  59.1 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  59.71 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  59.56 
 
 		 409 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  58.37 
 
 		 416 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  58.87 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  43 
 
 		 403 aa  322  9.000000000000001e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  39.61 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  35.75 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  36.52 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  36.27 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  35.5 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  36.02 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  34.74 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  34.49 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  36.3 
 
 		 430 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  35.38 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  32.49 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  32.78 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  34.95 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  34.39 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  26.74 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.13 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.8 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.11 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.13 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 335 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.85 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.55 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.38 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.8 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.1 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.98 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.07 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.7 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.24 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.24 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.21 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.24 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.18 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.57 
 
 		 312 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>