57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0420 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  73.83 
 
 		 416 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  100 
 
 		 409 aa  846    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  60.59 
 
 		 406 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  61.48 
 
 		 407 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  60.2 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  60.2 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  60.2 
 
 		 407 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  59.07 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  58.02 
 
 		 406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  58.82 
 
 		 409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  58.66 
 
 		 404 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  58.37 
 
 		 408 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  58.87 
 
 		 408 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  60.76 
 
 		 406 aa  501  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  57.67 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  56.68 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  56.4 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  55.11 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  40.55 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  36.76 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  35.24 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  34.75 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  35.24 
 
 		 408 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  34.89 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  34.58 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  34.58 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  34.74 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  35.39 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  35.41 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  31.48 
 
 		 363 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  33.99 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  30.11 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.42 
 
 		 373 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.14 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.09 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.14 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.7 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.73 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.24 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  23.9 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.12 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.73 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 		 510 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.27 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.5 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.27 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.27 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.04 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.58 
 
 		 325 aa  50.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  23.32 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>