60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2847 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  79.56 
 
 		 408 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  77.78 
 
 		 407 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  78.82 
 
 		 408 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  848    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  75.5 
 
 		 409 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  71.36 
 
 		 407 aa  628  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  71.36 
 
 		 407 aa  628  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  71.36 
 
 		 407 aa  628  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  69.38 
 
 		 406 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  68.23 
 
 		 409 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  67.41 
 
 		 406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  61.44 
 
 		 403 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  62.38 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  62.56 
 
 		 408 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  62.07 
 
 		 409 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  62.13 
 
 		 405 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  60.59 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  59.61 
 
 		 416 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  42.18 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  40.1 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  37.68 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  37.87 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  37.87 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  37.81 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  35.45 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  34.58 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  34.58 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  35.4 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  34.41 
 
 		 425 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  32.98 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  30.92 
 
 		 365 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  32.44 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.3 
 
 		 373 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  29.02 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.97 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.24 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.24 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.87 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.76 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  26.4 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.87 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.35 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.77 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.13 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 324 aa  53.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.23 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.62 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.64 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.95 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  24.58 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.86 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.86 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  24.86 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>