More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0395 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
510 aa  1046    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  34.29 
 
 
324 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
324 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.22 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.42 
 
 
343 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.6 
 
 
321 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.17 
 
 
319 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.88 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.71 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.47 
 
 
334 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.47 
 
 
334 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.47 
 
 
334 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.82 
 
 
299 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  28.47 
 
 
325 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.24 
 
 
326 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
320 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  27.52 
 
 
335 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
359 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.11 
 
 
342 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
316 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.77 
 
 
325 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
302 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
329 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
335 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.04 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  28.65 
 
 
330 aa  91.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  27.4 
 
 
406 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  26.03 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  25.65 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 
306 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  28.19 
 
 
306 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  29.38 
 
 
410 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  25.53 
 
 
318 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  28.05 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  28.7 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  27.32 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  25.11 
 
 
409 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  28.07 
 
 
404 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  25.69 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  25.98 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  25.34 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  31.37 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  27.72 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  27.68 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  26.77 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  27.64 
 
 
404 aa  77  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
236 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.41 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
231 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  28.43 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  28.87 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  29.74 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  26.94 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  28.93 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  26.42 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  21.71 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  28.72 
 
 
418 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  22.58 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  27.69 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  27.69 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  28.21 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  26.26 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  27.69 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  27.69 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.51 
 
 
1099 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  25.26 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  28.51 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0656  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.67 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.89 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  23.87 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  31.58 
 
 
693 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  27.88 
 
 
223 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
232 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  35.57 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  26.67 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  26.63 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  25.25 
 
 
213 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  25.13 
 
 
210 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
221 aa  69.3  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  24.66 
 
 
326 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  26.26 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0935  phosphoserine phosphatase  24.31 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  26.02 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  26.29 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  27.86 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  24.47 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>