193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2860 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 
325 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  51.27 
 
 
325 aa  338  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  47.39 
 
 
335 aa  262  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.36 
 
 
321 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  44.94 
 
 
320 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.03 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.06 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  41.77 
 
 
330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.47 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40 
 
 
326 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.41 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.14 
 
 
315 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.39 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  45.83 
 
 
324 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
324 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.82 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.38 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.52 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.03 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  39.1 
 
 
359 aa  206  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.01 
 
 
334 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.01 
 
 
334 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.01 
 
 
334 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
302 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
510 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
228 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  27.27 
 
 
408 aa  69.3  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  28.31 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  25.78 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  28.31 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  27.01 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  28.12 
 
 
408 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  29.73 
 
 
404 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  28.12 
 
 
408 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.04 
 
 
409 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  25.85 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
222 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.24 
 
 
407 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  25.76 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
230 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  29.05 
 
 
425 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  27.5 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.23 
 
 
409 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  29.05 
 
 
430 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  24.88 
 
 
416 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  27.27 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.32 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.32 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.32 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.73 
 
 
409 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  26.67 
 
 
391 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  27.52 
 
 
406 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  27.41 
 
 
408 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  33.91 
 
 
693 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  29.63 
 
 
365 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  28.19 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  26.92 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
226 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  27.92 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  29.63 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  25.78 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3245  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
277 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.164369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
238 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
213 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
797 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  24.37 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.5 
 
 
123 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
1268 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  29.19 
 
 
397 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  27.81 
 
 
227 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
234 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
235 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
279 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
640 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.84 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
247 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>