More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0708 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
235 aa  470  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3382  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  53.68 
 
 
225 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204913  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2091  putative glycosyltransferase  43.35 
 
 
231 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0883  hypothetical protein  37.67 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.91 
 
 
234 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  37.44 
 
 
234 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.91 
 
 
236 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  38.69 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2212  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
247 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0873625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  36.91 
 
 
422 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06271  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.65 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00807359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
232 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06191  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.3 
 
 
227 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05891  glycosyltransferase  38.07 
 
 
228 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0456221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
228 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
226 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.15 
 
 
231 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
441 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
458 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1990  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0970  hypothetical protein  38.07 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.801732  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7195  predicted protein  36.44 
 
 
242 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
435 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
234 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3258  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.777237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1271  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0642  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
226 aa  111  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1623  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
224 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4363  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 
187 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273335  normal  0.0171455 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2276  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
236 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1224  hypothetical protein  39.26 
 
 
188 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2220  hypothetical protein  32.73 
 
 
228 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.556627  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3554  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
227 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.413559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
233 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1593  glycosyl transferase  29.05 
 
 
230 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0588  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
244 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  33.77 
 
 
229 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04995  glycosyl transferase  32.37 
 
 
259 aa  102  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
238 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0827  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
232 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2625  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.98 
 
 
264 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0190736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2085  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1205  hypothetical protein  38.92 
 
 
187 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1079  hypothetical protein  36.75 
 
 
187 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1526  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
227 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000141803  normal  0.0950404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0589  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.16 
 
 
375 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0282701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2337  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
190 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0621  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
345 aa  92.8  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.378863  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1158  glycosyl transferase  29.11 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0755  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
244 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4586  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.876161  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1771  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3860  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1927  glycosyltransferase  27.39 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000076713  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  30.98 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2163  hypothetical protein  43 
 
 
160 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2740  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0878  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.91 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 
479 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2552  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
245 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0262728  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0711  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0723  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000115324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1283  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
376 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2448  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26292  predicted protein  27.98 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.147213  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.89 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0388  hypothetical protein  42.57 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0400  hypothetical protein  42.57 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
308 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
323 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  27.23 
 
 
479 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
528 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
683 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0562  putative glycosyltransferase protein  35 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
284 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
327 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.09 
 
 
427 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 
394 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0518  putative glycosyltransferase protein  34 
 
 
172 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  0.387851 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0453  hypothetical protein  35.83 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297407  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0509  hypothetical protein  38.1 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
415 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>