More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0219 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
247 aa  490  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.96 
 
 
479 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 
479 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.2 
 
 
481 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.54 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  32.08 
 
 
235 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
232 aa  105  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
240 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
235 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.16 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
257 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
398 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  44.64 
 
 
333 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
374 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.36 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.35 
 
 
300 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
305 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.75 
 
 
299 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  27.06 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  32.34 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.44 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  24.51 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.8 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.63 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
317 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  32.93 
 
 
694 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0708  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0202797  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
689 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  23.92 
 
 
422 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  30.32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  36.28 
 
 
697 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
345 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  37 
 
 
672 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  43.48 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.98 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
701 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  47.13 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  33.59 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  33.09 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  30.16 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.38 
 
 
1157 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
1035 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>