More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1742 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  43.94 
 
 
291 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
275 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  37.82 
 
 
308 aa  162  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
279 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  37.13 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
232 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
233 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
232 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 
479 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  38.35 
 
 
269 aa  99  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 
271 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  36.32 
 
 
298 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  33.18 
 
 
479 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.27 
 
 
1099 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
238 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.67 
 
 
481 aa  89  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
225 aa  89  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  45.54 
 
 
752 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.11 
 
 
1157 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.98 
 
 
580 aa  82.4  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  42.02 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
924 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  34.93 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
1115 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  34.93 
 
 
344 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  34.25 
 
 
344 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  32.31 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.92 
 
 
1119 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  34.93 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  34.93 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.92 
 
 
927 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.92 
 
 
1115 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  30.11 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.57 
 
 
872 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
374 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.36 
 
 
397 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 
1120 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.57 
 
 
1115 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  31.16 
 
 
785 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  35.51 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  30.65 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  36.61 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.35 
 
 
1115 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  37.9 
 
 
1066 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  32.11 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.71 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.1 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.9 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  31.72 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  26.52 
 
 
1169 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  44.44 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  24.74 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  32.33 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  38.24 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  39.13 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  32.33 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  32.33 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>