More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 580 aa  1139    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  45.66 
 
 		 335 aa  286  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  41.77 
 
 		 333 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  41.64 
 
 		 333 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  41.77 
 
 		 333 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  41.46 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  41.46 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  41.46 
 
 		 333 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  41.14 
 
 		 333 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  40.82 
 
 		 333 aa  250  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  41.14 
 
 		 333 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  41.14 
 
 		 333 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  40.51 
 
 		 333 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  44.11 
 
 		 346 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03920  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.62 
 
 		 297 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  46.09 
 
 		 298 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  48.29 
 
 		 269 aa  156  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  50.21 
 
 		 271 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  34.03 
 
 		 337 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3759  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 314 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  33.46 
 
 		 309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0033  NLP/P60 protein  26.4 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  32.61 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  29.7 
 
 		 292 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  34.11 
 
 		 245 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  44.03 
 
 		 273 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  34.84 
 
 		 281 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  28.29 
 
 		 266 aa  97.4  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  29.27 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  35.4 
 
 		 307 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  33.56 
 
 		 1048 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  28.32 
 
 		 532 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  27.48 
 
 		 424 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.72 
 
 		 265 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  32.5 
 
 		 308 aa  94  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 319 aa  94  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.65 
 
 		 232 aa  93.6  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  28.64 
 
 		 235 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  44.23 
 
 		 327 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.46 
 
 		 391 aa  91.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 183 aa  91.7  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 		 279 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  35 
 
 		 269 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.1 
 
 		 217 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 220 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 278 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  34.97 
 
 		 476 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  35.25 
 
 		 266 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 269 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  39.32 
 
 		 267 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.15 
 
 		 318 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  33.72 
 
 		 221 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 291 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.53 
 
 		 176 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  37.93 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  35.48 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  34.83 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  36.62 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  40 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.74 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  26.29 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 308 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  36.62 
 
 		 228 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  35.92 
 
 		 224 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  29.14 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 192 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 246 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.64 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 223 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  32.28 
 
 		 250 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  35.92 
 
 		 223 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  41.35 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  34.23 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  37.04 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  31.64 
 
 		 234 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  39.81 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  39.23 
 
 		 231 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  31.64 
 
 		 234 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 342 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  37.1 
 
 		 333 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  32.52 
 
 		 236 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  31.64 
 
 		 234 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  31.64 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  31.64 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>