More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  100 
 
 		 298 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  52.92 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.09 
 
 		 580 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  47.7 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  37.74 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02360  glycosyl transferase  41.58 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  31.33 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.1 
 
 		 236 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 235 aa  92.4  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 233 aa  86.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  36.28 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  40.78 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  29.91 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  38 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  36.73 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  30.84 
 
 		 1066 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.94 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  43.16 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  47.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 807 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  38.37 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  36.62 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.23 
 
 		 1115 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  25.23 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.41 
 
 		 2401 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 		 236 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 1739 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.03 
 
 		 1115 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.44 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  42.73 
 
 		 477 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  29.7 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 785 aa  56.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 752 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  28.07 
 
 		 1225 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>