More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1840 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  100 
 
 
308 aa  650    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  53.2 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  53.36 
 
 
275 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  37.82 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
286 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.48 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  31.33 
 
 
298 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
235 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  31.16 
 
 
269 aa  89  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.83 
 
 
580 aa  87.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
233 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0176  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.020767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.09 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.74 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.88 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
689 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
785 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  37.62 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.33 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
807 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
1301 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  34.86 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  22.93 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
1523 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  33.94 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.78 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
528 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.32 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
1523 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  33.94 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  33.94 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  33.94 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
398 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
384 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  24.15 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
312 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
402 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
1032 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.27 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
344 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.63 
 
 
316 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
573 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  27.5 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  32.11 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
401 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  31.37 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>