288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1024 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  100 
 
 
290 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  29.9 
 
 
334 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3187  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
333 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0795878  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
626 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  30.11 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
924 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
322 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.68 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  27.54 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
247 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  29.56 
 
 
461 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  27.8 
 
 
310 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  31.71 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
598 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.91 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
528 aa  56.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0208  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.4 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  24.88 
 
 
642 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 
1120 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
623 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
414 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 
1124 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
247 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  31.71 
 
 
247 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 
315 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
648 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
240 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.59 
 
 
236 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
531 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.11 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0145  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
345 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
230 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
689 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.42 
 
 
329 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  30.4 
 
 
326 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
341 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
327 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  26.73 
 
 
531 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  22.07 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  26.05 
 
 
315 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  21.94 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
347 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
341 aa  49.3  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
444 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
235 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  31.31 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 
460 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
331 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
338 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  26.87 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.36 
 
 
326 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>