More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0208 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0208  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0145  glycosyl transferase family protein  83.83 
 
 
307 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0143  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.41 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
357 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.5 
 
 
236 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
924 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0074  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.221966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.06 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.76 
 
 
1099 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
235 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  22.91 
 
 
403 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  28.22 
 
 
247 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
528 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
640 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
247 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  32.3 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
328 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
340 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
245 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.3 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
1162 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
1188 aa  59.3  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
249 aa  58.9  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  40.91 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0867  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.177979  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.33 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
495 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0376  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1404  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189362  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
521 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3100  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
247 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  30.28 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
544 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  31.62 
 
 
427 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.37 
 
 
252 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3929  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.63 
 
 
461 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
549 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 
1002 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
1334 aa  56.6  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
345 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.22 
 
 
234 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1549  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
254 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  32.35 
 
 
255 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.44 
 
 
1225 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  22.8 
 
 
274 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
247 aa  55.8  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.05 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  32.67 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.89 
 
 
716 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.05 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
597 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.32 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  36.79 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>