More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5551 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
319 aa  634    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  99.37 
 
 
319 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  93.1 
 
 
319 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  93.1 
 
 
319 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  93.1 
 
 
319 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  93.42 
 
 
319 aa  577  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  88.68 
 
 
319 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  78.06 
 
 
1066 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  78.06 
 
 
326 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.74 
 
 
326 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  78.39 
 
 
315 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  72.13 
 
 
310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  71.48 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  71.48 
 
 
318 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  50.33 
 
 
310 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  52.99 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  49.67 
 
 
317 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  44.06 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
924 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  26.79 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  34.86 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  29.25 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
300 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.63 
 
 
700 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.18 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
487 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.34 
 
 
754 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
477 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
598 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  30.83 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  23.97 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2508  glycosyl transferase, family 2  30 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  25.93 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
275 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6751  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  27.91 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
333 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  40.35 
 
 
270 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  28.42 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
238 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  32.3 
 
 
792 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3769  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  31.48 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  28.95 
 
 
1041 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
513 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  32.73 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
1267 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
1435 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  21.94 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  29.39 
 
 
1837 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
1077 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1678  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
232 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.17 
 
 
980 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
822 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.19 
 
 
403 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03360  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  29.85 
 
 
580 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
528 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.03 
 
 
860 aa  53.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>