210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0308 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  100 
 
 
309 aa  630  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
296 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  32.27 
 
 
1041 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  27.39 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  25.6 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  30.97 
 
 
642 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3118  family 2 glycosyl transferase  35.46 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
532 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  30.63 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  35.77 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
313 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  27.63 
 
 
326 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
598 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  27.64 
 
 
1065 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.8 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.17 
 
 
1132 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  31.71 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
626 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3741  putative glycosyltransferase  33.33 
 
 
275 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
454 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  33.64 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  23.79 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
924 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.71 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
319 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
333 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
333 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
319 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  37.19 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3187  glycosyl transferase family protein  20.92 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0795878  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  31.03 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
525 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  24.39 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0838  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
349 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
756 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
341 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>