More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0306 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  100 
 
 
1041 aa  2101    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  54.83 
 
 
1065 aa  1046    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  31.95 
 
 
535 aa  132  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  29.68 
 
 
526 aa  125  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  29.24 
 
 
586 aa  124  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1701  sulfatase  29.92 
 
 
483 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  26.94 
 
 
784 aa  119  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  29.64 
 
 
485 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  27.24 
 
 
478 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  28.06 
 
 
516 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  28.72 
 
 
482 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  27.94 
 
 
507 aa  112  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  27.25 
 
 
494 aa  111  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  29.82 
 
 
516 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.43 
 
 
516 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  26.74 
 
 
447 aa  110  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  29.82 
 
 
516 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.9 
 
 
480 aa  110  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  26.71 
 
 
511 aa  109  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  28.91 
 
 
511 aa  108  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.82 
 
 
559 aa  108  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  25 
 
 
466 aa  108  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.65 
 
 
489 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  26.99 
 
 
511 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  26.57 
 
 
515 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  24.16 
 
 
500 aa  105  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  26.54 
 
 
517 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  26.54 
 
 
522 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  23.91 
 
 
549 aa  105  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  26.54 
 
 
522 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  26.54 
 
 
522 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  26.54 
 
 
522 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  26.54 
 
 
522 aa  105  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  28.35 
 
 
509 aa  105  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  26.11 
 
 
517 aa  105  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  26.67 
 
 
505 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  25.77 
 
 
512 aa  104  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  26.67 
 
 
505 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  25.38 
 
 
499 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  27.45 
 
 
457 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  25.83 
 
 
517 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.83 
 
 
518 aa  102  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.86 
 
 
564 aa  102  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  28.38 
 
 
505 aa  102  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3320  sulfatase  24.31 
 
 
520 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000925232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  26.67 
 
 
505 aa  101  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  25.43 
 
 
499 aa  101  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.84 
 
 
537 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  27.3 
 
 
502 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  25.46 
 
 
501 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  26.67 
 
 
511 aa  99  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  26.21 
 
 
594 aa  98.2  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.01 
 
 
479 aa  98.2  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0770  sulfatase  27.58 
 
 
486 aa  97.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.119074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0538  sulfatase  26.34 
 
 
451 aa  96.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  24.62 
 
 
506 aa  97.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.51 
 
 
498 aa  95.9  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
314 aa  95.9  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.11 
 
 
519 aa  95.9  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  24.4 
 
 
490 aa  95.9  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  24.89 
 
 
501 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.62 
 
 
489 aa  95.1  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.35 
 
 
491 aa  95.1  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  27.7 
 
 
565 aa  95.1  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  25.27 
 
 
481 aa  94.7  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  26.44 
 
 
496 aa  94.7  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  25.19 
 
 
511 aa  94.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  25.99 
 
 
493 aa  94.4  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.37 
 
 
503 aa  94  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  26.13 
 
 
513 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  25.75 
 
 
511 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  25.6 
 
 
502 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.24 
 
 
519 aa  92.8  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.53 
 
 
482 aa  93.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.08 
 
 
486 aa  92.8  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  24.51 
 
 
657 aa  92.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  25.7 
 
 
458 aa  92.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.97 
 
 
486 aa  92.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  23.9 
 
 
535 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  25.25 
 
 
474 aa  91.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  32.27 
 
 
309 aa  91.3  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  25.32 
 
 
510 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  24.85 
 
 
508 aa  90.9  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  28.15 
 
 
520 aa  90.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  25.49 
 
 
509 aa  90.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
331 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  27.25 
 
 
491 aa  90.1  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  27.09 
 
 
503 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.06 
 
 
508 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  25.6 
 
 
512 aa  90.1  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3275  sulfatase  24.09 
 
 
652 aa  89.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  27.88 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3641  sulfatase  25.6 
 
 
486 aa  89.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000013502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  28.53 
 
 
438 aa  89.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.48 
 
 
501 aa  89.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  24.1 
 
 
517 aa  89  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  25.38 
 
 
495 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.93 
 
 
502 aa  89  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  22.24 
 
 
554 aa  88.6  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>