207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3928 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 532 aa  1063    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  58.7 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  48.15 
 
 		 598 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  44.81 
 
 		 623 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  42.8 
 
 		 333 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  43.17 
 
 		 315 aa  216  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  43.8 
 
 		 313 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  42.21 
 
 		 337 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  38.63 
 
 		 328 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2678  hypothetical protein  43.07 
 
 		 218 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.13 
 
 		 1132 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 311 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 319 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 307 aa  120  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 310 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 305 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.09 
 
 		 331 aa  90.5  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 296 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  29.56 
 
 		 322 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  29.53 
 
 		 310 aa  87.8  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 313 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  31.71 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 310 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.18 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 312 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  29.07 
 
 		 1041 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  29.25 
 
 		 1065 aa  60.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  31.34 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  22.71 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 296 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 626 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  25.2 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 302 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  28.65 
 
 		 313 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  25.42 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  27.69 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  28.94 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  24.29 
 
 		 281 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 301 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 323 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 317 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 301 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 924 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.48 
 
 		 300 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  29.81 
 
 		 267 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 305 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  39.58 
 
 		 561 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 333 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 		 460 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  28.07 
 
 		 326 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 691 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  36.46 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  26.17 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 988 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.05 
 
 		 317 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 319 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 319 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 319 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 311 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 341 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  27.87 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 315 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 785 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 295 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 326 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  33.63 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  22.99 
 
 		 292 aa  47.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 		 324 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>