140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2755 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  621  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  55.67 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  49.66 
 
 
334 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  54.79 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  49.66 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  53.98 
 
 
316 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  52.61 
 
 
300 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
331 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.23 
 
 
337 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
597 aa  79.7  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
924 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
477 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  30.36 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
623 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.56 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 
341 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  26.8 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  31.27 
 
 
353 aa  59.3  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  26.63 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  26.17 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  28.72 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
753 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.12 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 
311 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
470 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.19 
 
 
1120 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.42 
 
 
403 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
513 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  26.11 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  32.37 
 
 
474 aa  52.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
360 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
598 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
471 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
454 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
421 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
308 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
233 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
317 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
460 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
470 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 
394 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.62 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  24 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  26.54 
 
 
470 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  26.98 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  32.98 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  23.15 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  25.19 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
487 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
379 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
748 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.15 
 
 
309 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  30.54 
 
 
341 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.72 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
586 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  26.06 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0210  hypothetical protein  22.82 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
484 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>