220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8185 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
301 aa  607  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  48.63 
 
 
295 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  43.39 
 
 
307 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.45 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
329 aa  108  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  26.03 
 
 
309 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.36 
 
 
289 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  29.73 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  29.73 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  29 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  29 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  28.03 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  28.67 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  28.81 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  28.33 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  28.33 
 
 
331 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  28.33 
 
 
331 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  28.33 
 
 
331 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  28.33 
 
 
331 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  28.33 
 
 
331 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  26.46 
 
 
312 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  26.46 
 
 
312 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  26.46 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  28.57 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  28 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  28 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  27.96 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  27.96 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  28 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  28 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  29.41 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  28.14 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  27.55 
 
 
312 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  26.37 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.26 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  23.81 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  24.15 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  23.81 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  23.81 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 
722 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  30.28 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  24.67 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  27.02 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  27.15 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  27.15 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  27.15 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  23.88 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  29.75 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  25.78 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  24.23 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  25.08 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  29.24 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  28.69 
 
 
302 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 
1120 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 
322 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  21.65 
 
 
616 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
1435 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
623 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  41.94 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  27.23 
 
 
352 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  39.39 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
274 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  46.3 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
325 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  22.02 
 
 
455 aa  52.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
324 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1650  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
679 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  29.41 
 
 
561 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.98 
 
 
403 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
598 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.76 
 
 
286 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>