80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4930 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
289 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.38 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  27.18 
 
 
325 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  27.3 
 
 
300 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 
282 aa  105  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  25.17 
 
 
303 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
301 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  23.68 
 
 
298 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  24.48 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  24.48 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  24.48 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  25.66 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  25.66 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  25.66 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  23.51 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
307 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  25.33 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  25.5 
 
 
312 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  26.44 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  26.44 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  26.44 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  27.81 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  26.44 
 
 
294 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  24.03 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  24.83 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  28.16 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  22.37 
 
 
321 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  22.37 
 
 
321 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  22.26 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  22.26 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  22.76 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  22.76 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  22.76 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  22.76 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  22.76 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  22.76 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  22.29 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  22.29 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  21.94 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  21.94 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  21.94 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  21.94 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  28.95 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  25.17 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  23.05 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  22.68 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  22.81 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  24.89 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  23.75 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  24.37 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
455 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  23.73 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  22.76 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  19 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2894  glycosyl transferase family protein  21.86 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  20.2 
 
 
722 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.42 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2234  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
259 aa  48.9  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  20.67 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
330 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  21.68 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  22.88 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2759  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.786186  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
258 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  19.77 
 
 
311 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  20.74 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>