150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0633 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
287 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.38 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  32.45 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  30.69 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  30.69 
 
 
294 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  30.69 
 
 
294 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  30.34 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  32.21 
 
 
325 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  32.21 
 
 
312 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  31.68 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  31.88 
 
 
312 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  31.1 
 
 
312 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  31.88 
 
 
312 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  31.54 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  31.72 
 
 
286 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  31.72 
 
 
286 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  31.54 
 
 
312 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  34.29 
 
 
300 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  30.16 
 
 
321 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  30.16 
 
 
321 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  30.1 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
297 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  29.19 
 
 
303 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
299 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  28.89 
 
 
335 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  28.89 
 
 
335 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
322 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  29.58 
 
 
331 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  29.58 
 
 
331 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  29.58 
 
 
331 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  29.58 
 
 
331 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  29.58 
 
 
331 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  29.58 
 
 
331 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  29.58 
 
 
331 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  29.58 
 
 
331 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  29.26 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  29.26 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  29.26 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  29.26 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  28.52 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  25 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
305 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.11 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  32.37 
 
 
318 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  39.13 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  37.2 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  38.16 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  31.74 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  25.08 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
303 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  31.03 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  27.56 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
455 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  25.26 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  27.35 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
489 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  26.83 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  22.08 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  24.17 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  21.66 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  22.38 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
346 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  25.1 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
970 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
337 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
539 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
1162 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.77 
 
 
2401 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.39 
 
 
838 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
616 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
841 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  24.5 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
1340 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>