27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1468 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  640    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  24.44 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.82 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  26.45 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  24.83 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  24.58 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.61 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.55 
 
 
287 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  23.63 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  23.39 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
314 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  23.39 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.36 
 
 
321 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  34.78 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  25.64 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
312 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>