156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2177 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  100 
 
 
323 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  49.32 
 
 
300 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  41.64 
 
 
308 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
297 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  38.49 
 
 
298 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  36.36 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  37.8 
 
 
299 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  37.59 
 
 
286 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  37.59 
 
 
286 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  36.22 
 
 
303 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
295 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  32.11 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  32.08 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  31.95 
 
 
292 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
321 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  27.55 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  30.51 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  27.21 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  27.21 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 
282 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  26.05 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  27.12 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  29.73 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  29.87 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  29.87 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  27.63 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.51 
 
 
289 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  29.39 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  29.39 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  29.39 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  30.66 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  29.39 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  29.39 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  29.39 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  29.39 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  29.39 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  29.02 
 
 
335 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  29.02 
 
 
335 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  29.07 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  29.07 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  29.07 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  29.07 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
309 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  28.52 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  28.67 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  28.67 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  28.15 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.08 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  28.51 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  23.79 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  27.68 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  24.39 
 
 
302 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  26.3 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  25.6 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.96 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.69 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
282 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
302 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
307 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.09 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
785 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
324 aa  52.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 
489 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.05 
 
 
305 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.71 
 
 
535 aa  50.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3936  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
266 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
310 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.91 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.68 
 
 
700 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  20.26 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>