83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3397 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  96.6 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  96.6 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  96.26 
 
 		 294 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  40.71 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  40.71 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  40.32 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  40.32 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  40.07 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  40.07 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  40.07 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  40.07 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  40.07 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  40.07 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  39.55 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  40.41 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  39.55 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  39.74 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  39.74 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  40.07 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  39.74 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  39.74 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  40.41 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  40.41 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  38.7 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  38.72 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  38.36 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  38.7 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.34 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  32.25 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.05 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  30.23 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  28.67 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  27.12 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  29.97 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  28.52 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  28.52 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  26.09 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  28.23 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  28.24 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  28.67 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  28.94 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  27 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  28.51 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  24.07 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  24.87 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  29.33 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  21.89 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  21.3 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.94 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  21.68 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.3 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 		 616 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  22.91 
 
 		 455 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.47 
 
 		 722 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1590  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>