180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1399 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  33.58 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
302 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
306 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
303 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  33.65 
 
 
306 aa  103  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  36.32 
 
 
322 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  35.05 
 
 
292 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
297 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  27.74 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  30.14 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  38.41 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  27.94 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
616 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  26.98 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  29.96 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
455 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  32.52 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  30.69 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  43.75 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  27.19 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  26.81 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  27.19 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  31.08 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  26.24 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  28.35 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  31.08 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  39.83 
 
 
874 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  29.66 
 
 
674 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
671 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  27.46 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  27.46 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  27.46 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
324 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  27.05 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.05 
 
 
754 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2725  putative glucosyltransferase  30.18 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  28.46 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.82 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  38.02 
 
 
262 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
1119 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
633 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.04 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.04 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.04 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.07 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  36.94 
 
 
883 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  28.37 
 
 
639 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  36.51 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
242 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  28.72 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
680 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  33.86 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.75 
 
 
252 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  33.01 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3118  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.04 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360955  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2704  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  39.29 
 
 
263 aa  49.3  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15970  glycosyl transferase  33.64 
 
 
251 aa  49.3  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>