224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0629 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  100 
 
 		 308 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  41.64 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  37.84 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  34.8 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  36.52 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  35.49 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  35.49 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  34.88 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  33.67 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  32.19 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.97 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  30.17 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.19 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  28.62 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  28 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  27.09 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  27.09 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  27.09 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  27.59 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  29.03 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  29.03 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  29.37 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  27.96 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  27.63 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  28.8 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  28.8 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  28.8 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  28.8 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  28.8 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  28.8 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  28.8 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  28.8 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  28.3 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  28.3 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.75 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.72 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  28.48 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  28.48 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  28.48 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  28.48 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  30.42 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  27.96 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  27.96 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  30.83 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  26.64 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.25 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  30.87 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  29.46 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  28.68 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  30.53 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  29.61 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.47 
 
 		 838 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.95 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  22.78 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 1562 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  24.31 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 785 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4069  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 1072 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  19.87 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>