81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6638 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  100 
 
 
294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  99.32 
 
 
294 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  96.6 
 
 
294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  41.31 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  41.31 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  40.13 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  40.13 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  40.69 
 
 
312 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  40.69 
 
 
312 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  39.47 
 
 
331 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  39.47 
 
 
331 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  40.69 
 
 
312 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  39.47 
 
 
331 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  39.47 
 
 
331 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  39.47 
 
 
331 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  39.47 
 
 
331 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  40.34 
 
 
312 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  38.96 
 
 
335 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  38.96 
 
 
335 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  39.14 
 
 
331 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  39.14 
 
 
331 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  39.14 
 
 
331 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  39.14 
 
 
331 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  39.06 
 
 
309 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  38.62 
 
 
312 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  38.28 
 
 
312 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  39.73 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  33.77 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.69 
 
 
287 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  31.56 
 
 
303 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  28.29 
 
 
303 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
329 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  27.21 
 
 
323 aa  95.9  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  28.15 
 
 
299 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
286 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  28.72 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  27.85 
 
 
286 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.44 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  28.57 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  26.09 
 
 
308 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  27.57 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  29.9 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  28.94 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  25 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  27 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  23.18 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  26.97 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  33.09 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  29.34 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
489 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  21.93 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  22.12 
 
 
305 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  20.46 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  22.68 
 
 
455 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
342 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  22.33 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 
722 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.47 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
616 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  23.53 
 
 
300 aa  42.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>