241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0541 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  100 
 
 
300 aa  613  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  49.32 
 
 
323 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  39 
 
 
299 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  38.78 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  38.78 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  37.71 
 
 
298 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
297 aa  168  8e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  36.95 
 
 
303 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  37.84 
 
 
308 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  36.33 
 
 
321 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
295 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  28.67 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  31.2 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  27.12 
 
 
288 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
329 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.3 
 
 
289 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
287 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
321 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  29.61 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  32.09 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  28.33 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  31.46 
 
 
318 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.05 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  28.91 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  28.57 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  28.57 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  28.23 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  23.08 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  29.94 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  29.94 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  30.31 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  31.34 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  26.94 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  30.07 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  30.07 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  30 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  30 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  30 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  30 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  29.74 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  29.41 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  30.5 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  30.5 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  28.66 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  28.66 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  29.93 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
1523 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  30.29 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
1523 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  22.34 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 
455 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.06 
 
 
754 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.4 
 
 
652 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  23.34 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
705 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
1162 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  21.18 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>