126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0687 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0687  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1079  rhamnosyltransferase family protein  41.37 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0415995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1877  rhamnosyltransferase family protein  41.37 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0728  rhamnosyltransferase  40.51 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1829  rhamnosyltransferase  40.51 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0371  rhamnosyltransferase II  40.51 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110599  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0462  rhamnosyltransferase II  40.51 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0923  rhamnosyltransferase family protein  40.51 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2097  rhamnosyltransferase II  40.51 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0099449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0459  rhamnosyltransferase family protein  40.51 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0720  rhamnosyltransferase II  40.51 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000325438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0814  rhamnosyltransferase  40 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0467732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1917  rhamnosyltransferase II  40 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0189  dTDP-rhamnosyl transferase rfbf protein  40.19 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1016  rhamnosyltransferase II  40.19 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.940523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1419  rhamnosyltransferase family protein  40.19 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646273  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1990  rhamnosyltransferase II  40.19 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00265591  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5189  rhamnosyltransferase  38.16 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5030  rhamnosyltransferase  38.38 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.990279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0560  rhamnosyltransferase  37.83 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3275  rhamnosyltransferase  38.38 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0196034  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5093  rhamnosyltransferase  38.38 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.491648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  39.06 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4505  rhamnosyltransferase  38.05 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.661015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  39.06 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  38.72 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  38.72 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49760  rhamnosyltransferase 2  38.54 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 329 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.45 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0882  rhamnosyltransferase  32.01 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8183  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.123553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8185  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3054  glycosyltransferase-like protein  29.35 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2315  rhamnosyltransferase  33.86 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0541  rhamnosyltransferase  28.33 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.524826  normal  0.174898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  27.63 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0964  glycosyl transferase family protein  26.06 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0846  rhamnosyltransferase  31.49 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0700283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3205  rhamnosyltransferase  25.91 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.363372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8190  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0393  rhamnosyltransferase  30.92 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0875  rhamnosyltransferase  30.92 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3502  rhamnosyltransferase  33.8 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.099616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3302  rhamnosyltransferase  33.49 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3625  rhamnosyltransferase  34.25 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.896499  normal  0.372836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0629  rhamnosyltransferase  29.04 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5332  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2565  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1200  WbwY  26.54 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.771047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2685  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03053  Rhamnosyltransferase  28.02 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.753306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4930  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.05 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5951  rhamnosyltransferase  30.85 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1610  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1578  rhamnosyltransferase  32.68 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  27.27 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5218  rhamnosyltransferase  29.22 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2416  glycosyl transferase family 2  23.34 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.518239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.01 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  21.51 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1468  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0257921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  31.64 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  25.78 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 1267 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  20.89 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  21.86 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6266  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  25.41 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1411  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.25 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1148  glycosyltransferase  23.77 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000022742  hitchhiker  0.00000000318064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.44 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  21.08 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  23.99 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  25.52 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.26 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  21.67 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>