220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1180 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  100 
 
 		 322 aa  670    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  54.61 
 
 		 299 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  34.95 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  34.82 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  35.45 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  32.59 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 615 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 633 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.82 
 
 		 296 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  28.15 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  31.47 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  28.93 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  29.96 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  26.54 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.43 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.25 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.34 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  26.67 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.79 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.21 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  22.64 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.45 
 
 		 722 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 884 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  26.38 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  28.46 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 1340 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 395 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.32 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.32 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  27.42 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  26.48 
 
 		 653 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  26.09 
 
 		 648 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 		 671 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 1523 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  23.3 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.89 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 1268 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  28.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  23.11 
 
 		 1119 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 1435 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>