More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6342 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  61.39 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  45.08 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.03 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 332 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  31.73 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.56 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 353 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 841 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  40.96 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 337 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 337 aa  95.9  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 		 822 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 476 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 1340 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 836 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26.14 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  32.23 
 
 		 838 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 337 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 359 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 841 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 679 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.97 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  32.61 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 1739 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  22.04 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  32.88 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  22.31 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 624 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  22.31 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.63 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  22.26 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  32.23 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.91 
 
 		 2401 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 700 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  21.29 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 892 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  32.46 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  20.49 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  31.67 
 
 		 954 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>