More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6387 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
340 aa  711    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  57.23 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  47.65 
 
 
336 aa  335  7e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  49.11 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  47.94 
 
 
338 aa  335  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  47.65 
 
 
339 aa  332  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  47.16 
 
 
341 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  48.66 
 
 
325 aa  318  7.999999999999999e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  44.25 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.43 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  37.35 
 
 
355 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
353 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  36.39 
 
 
358 aa  203  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  36.11 
 
 
348 aa  189  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  35.6 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
337 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  29.02 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
294 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
300 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
303 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
841 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.19 
 
 
838 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.47 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
318 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
822 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
311 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
836 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
306 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
320 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
312 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
305 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
315 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
337 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
455 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
325 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1137 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  29.17 
 
 
1074 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
298 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
339 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
306 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
346 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
401 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
1267 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
841 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
557 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
378 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
298 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  26.46 
 
 
954 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
345 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.2 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
1340 aa  89.7  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
317 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
616 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
705 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
313 aa  87  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
313 aa  87  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  24.44 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  28.72 
 
 
291 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
342 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
306 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  26.64 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>