More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1400 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
306 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
302 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  32.6 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
315 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
297 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
341 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.88 
 
 
344 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  35.89 
 
 
300 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.39 
 
 
322 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  33.05 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
323 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 
615 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  30.22 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  31.91 
 
 
337 aa  95.5  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
489 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
322 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  30.5 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  28.52 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.97 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.64 
 
 
754 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  28.69 
 
 
723 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  31.64 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  32.11 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  25.4 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  25.28 
 
 
659 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  30.73 
 
 
997 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.51 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  26.72 
 
 
674 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
722 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  30.93 
 
 
954 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
1267 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.76 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  29.01 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  31.73 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  21.32 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.36 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  24.7 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  24.7 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  33.17 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  25.93 
 
 
653 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  24.7 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
1267 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  23.9 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
841 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  28.57 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
325 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
337 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  21.75 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
401 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  28.51 
 
 
1074 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>