43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1402 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  100 
 
 
659 aa  1358    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  51.36 
 
 
659 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  47.73 
 
 
656 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  47.17 
 
 
669 aa  614  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  47.17 
 
 
671 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  46.85 
 
 
674 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  45.81 
 
 
658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  46.96 
 
 
723 aa  598  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  45.34 
 
 
678 aa  508  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  42.69 
 
 
639 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  40.44 
 
 
648 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  41.11 
 
 
651 aa  432  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  39.07 
 
 
653 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  38.25 
 
 
641 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  38.25 
 
 
641 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  38.25 
 
 
641 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  38.42 
 
 
637 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  39.8 
 
 
650 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  32.34 
 
 
624 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  33.55 
 
 
620 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  29.35 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  22.06 
 
 
621 aa  122  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  22.96 
 
 
592 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  22.72 
 
 
592 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  22.96 
 
 
592 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  21.8 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
306 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
455 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.28 
 
 
754 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
302 aa  57.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
303 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
314 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  24.18 
 
 
300 aa  47.4  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  23.79 
 
 
337 aa  47  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
317 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
318 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 
293 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
329 aa  44.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
324 aa  44.3  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  19.01 
 
 
342 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
346 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
330 aa  43.9  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>