37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0205 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  61.41 
 
 
641 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
650 aa  1332    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  61.16 
 
 
637 aa  767    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  61.84 
 
 
648 aa  804    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  61.56 
 
 
641 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  61.27 
 
 
653 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  61.41 
 
 
641 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  74.72 
 
 
651 aa  967    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  49.39 
 
 
639 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  40.85 
 
 
658 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  39.63 
 
 
659 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 
669 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  37.4 
 
 
659 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  36.86 
 
 
674 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
671 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  38.89 
 
 
656 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
678 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  35.31 
 
 
723 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  32.24 
 
 
624 aa  318  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  31.11 
 
 
620 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  28.13 
 
 
570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  23.36 
 
 
621 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.52 
 
 
592 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.52 
 
 
592 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.28 
 
 
592 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  21.9 
 
 
635 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  22.18 
 
 
754 aa  53.9  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
455 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
306 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1790  hypothetical protein  37.27 
 
 
268 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.25426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
302 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
317 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
302 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  23.63 
 
 
300 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  21 
 
 
318 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
346 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>