33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0162 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  61.97 
 
 
641 aa  802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  74.72 
 
 
650 aa  958    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  100 
 
 
651 aa  1338    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  61.12 
 
 
637 aa  790    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  62.03 
 
 
648 aa  805    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  61.97 
 
 
641 aa  802    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  61.72 
 
 
653 aa  811    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  62.12 
 
 
641 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  49.68 
 
 
639 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  41.11 
 
 
659 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  38.8 
 
 
658 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 
669 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  38.94 
 
 
659 aa  440  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  37.67 
 
 
674 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
671 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
678 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  39.8 
 
 
656 aa  412  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  37 
 
 
723 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  33.76 
 
 
624 aa  323  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  33.23 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  30.76 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  22.81 
 
 
621 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  24.22 
 
 
592 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  24.22 
 
 
592 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.98 
 
 
592 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  23.23 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
455 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  20.65 
 
 
754 aa  51.6  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 
317 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  24.9 
 
 
300 aa  47.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
306 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 
308 aa  45.8  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>