52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4320 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  100 
 
 
639 aa  1292    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  47.02 
 
 
637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  49.68 
 
 
651 aa  578  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  46.96 
 
 
641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  46.96 
 
 
641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  47.04 
 
 
648 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  46.81 
 
 
641 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  46.21 
 
 
653 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  49.39 
 
 
650 aa  571  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  41.81 
 
 
659 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  41.58 
 
 
658 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  42.69 
 
 
659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 
669 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 
671 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  39.59 
 
 
674 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  43.75 
 
 
656 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  39 
 
 
723 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 
678 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  36.2 
 
 
624 aa  333  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  36.48 
 
 
620 aa  323  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  24.25 
 
 
621 aa  174  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  30.25 
 
 
570 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.25 
 
 
592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.41 
 
 
592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.41 
 
 
592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  23.99 
 
 
635 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  21.61 
 
 
754 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
489 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.92 
 
 
455 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
302 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  26.07 
 
 
300 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
314 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 
298 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
315 aa  51.2  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
306 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.39 
 
 
322 aa  48.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  28.92 
 
 
337 aa  48.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
303 aa  48.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1790  hypothetical protein  26.7 
 
 
268 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.25426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
832 aa  47.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  22.76 
 
 
305 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
310 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
302 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 
361 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  21.11 
 
 
344 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.55 
 
 
344 aa  44.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
304 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 
1152 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
318 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 
308 aa  43.9  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
298 aa  43.9  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>