39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  100 
 
 
624 aa  1285    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  50.25 
 
 
620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  34.8 
 
 
648 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  34.22 
 
 
653 aa  342  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  34.49 
 
 
641 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  34.49 
 
 
641 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  34.49 
 
 
641 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  35.07 
 
 
674 aa  337  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  35.3 
 
 
637 aa  335  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  36.2 
 
 
639 aa  333  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
671 aa  332  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  34.71 
 
 
658 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  35.15 
 
 
723 aa  323  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  34.55 
 
 
656 aa  319  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  34.71 
 
 
659 aa  319  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
669 aa  316  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  33.76 
 
 
651 aa  306  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  32.24 
 
 
650 aa  299  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  32.34 
 
 
659 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  34.49 
 
 
678 aa  284  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  29.23 
 
 
570 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  23.43 
 
 
621 aa  114  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.44 
 
 
592 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.27 
 
 
592 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.27 
 
 
592 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  23.99 
 
 
635 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 
754 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  30.54 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
489 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
455 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
306 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  24.54 
 
 
304 aa  56.6  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  28.24 
 
 
337 aa  52  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
303 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
282 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
307 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  28.65 
 
 
344 aa  44.7  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>