57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3887 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  51.52 
 
 
658 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  52.21 
 
 
674 aa  715    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  53.34 
 
 
671 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
669 aa  1368    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  49.69 
 
 
659 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  47.17 
 
 
659 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  48.77 
 
 
656 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  44.66 
 
 
723 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  45.27 
 
 
678 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  41.09 
 
 
653 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  41.4 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  40.27 
 
 
641 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  40.27 
 
 
641 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  40.27 
 
 
641 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  40.25 
 
 
639 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  38.87 
 
 
637 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  40.71 
 
 
651 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  39.87 
 
 
650 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  33.95 
 
 
620 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  35.41 
 
 
624 aa  316  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  30.79 
 
 
570 aa  175  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  19.74 
 
 
621 aa  111  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.99 
 
 
592 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.72 
 
 
592 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  23.99 
 
 
592 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  23.55 
 
 
635 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
489 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  22.54 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
306 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
318 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  23.43 
 
 
300 aa  53.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
346 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
314 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
299 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
313 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
302 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  23.51 
 
 
304 aa  50.4  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
297 aa  48.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
304 aa  48.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
303 aa  47.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  25.95 
 
 
320 aa  47.4  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
317 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2996  rhamnosyltransferase  25.2 
 
 
321 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
328 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
298 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
318 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  31.37 
 
 
295 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
308 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
841 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2725  putative glucosyltransferase  25.2 
 
 
302 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 
324 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.6 
 
 
2401 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  27.03 
 
 
337 aa  44.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
544 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
270 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
344 aa  43.9  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>