32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0848 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0881  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  99.32 
 
 
592 aa  1216    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.22195  normal  0.346157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0848  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  100 
 
 
592 aa  1221    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0412528  decreased coverage  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0784  putative glycosyltransferase, cell wall biogenesis  99.32 
 
 
592 aa  1215    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.0467489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0517  family 2 glycosyl transferase  28.83 
 
 
621 aa  239  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4003  hypothetical protein  28.18 
 
 
635 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.738232  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13842  bifunctional UDP-galactofuranosyl transferase glfT  27.12 
 
 
637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.888345  normal  0.478345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08870  predicted glycosyltransferase  24.71 
 
 
659 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.313185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5400  glycosyltransferases-like protein  25.37 
 
 
641 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4320  glycosyltransferase  23.25 
 
 
639 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5019  glycosyltransferases-like protein  25.16 
 
 
641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5107  glycosyltransferases-like protein  25.16 
 
 
641 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351774  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1160  glycosyltransferases-like protein  27.64 
 
 
648 aa  115  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.417829  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4324  glycosyltransferase  21.79 
 
 
620 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.77529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5649  glycosyltransferases-like protein  26.78 
 
 
653 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01420  predicted glycosyltransferase  23.44 
 
 
624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0968148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0636  glycosyltransferase-like protein  24.01 
 
 
658 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2574  glycosyltransferase-like protein  24.89 
 
 
656 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20840  predicted glycosyltransferase  24.2 
 
 
723 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1402  putative glycosyltransferase  22.72 
 
 
659 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2423  glycosyl transferase, family 2  25.53 
 
 
674 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.121377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
671 aa  87  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0205  glycosyltransferase-like protein  23.28 
 
 
650 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0162  putative galactofuranosyltransferase  23.98 
 
 
651 aa  82.4  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1219  glycosyl transferase family protein  20.83 
 
 
678 aa  65.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26380  predicted glycosyltransferase  26.92 
 
 
570 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
455 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
297 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  32.32 
 
 
297 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  32.32 
 
 
297 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  32.32 
 
 
297 aa  44.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  25.55 
 
 
320 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>