More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4001 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.87 
 
 
296 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  28.74 
 
 
297 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  28.74 
 
 
297 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 
297 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  26.92 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  32.14 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  29.11 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
615 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  23.31 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  29.45 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.98 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  20.16 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  36 
 
 
754 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  25.47 
 
 
293 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.52 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
633 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
290 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.24 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.91 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.29 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
1340 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
331 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37410  glycosyl transferase  30.17 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0782331  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
616 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
836 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
328 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
329 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
841 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  23.81 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
1267 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
247 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  22.47 
 
 
1739 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.22 
 
 
2401 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  25.33 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  33.33 
 
 
348 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0162  putative glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
316 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
304 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
300 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
279 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
489 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.99 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2369  putative glycosyl transferase  28.91 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.12 
 
 
722 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
679 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
1267 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>