More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4543 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 332 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  35.38 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  32.46 
 
 		 306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  34.05 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  33.12 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  37.96 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 615 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 		 633 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  33.73 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  31.97 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  24.34 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 455 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  28.21 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.57 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.76 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  26.61 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  26.58 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  36.27 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  37.25 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  37.25 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.25 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  37.38 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 1268 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 689 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  23.9 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 1523 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  22.65 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3764  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 1137 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.3 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  27.59 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1435 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 884 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 1523 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1074 aa  59.7  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 954 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.24 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.12 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  28.05 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>